TB-SMART 助力结核病精准防控
全基因组测序技术已经广泛应用于结核分枝杆菌的研究中，包括谱系鉴定、微进化、耐药预测、传播监测、混合感染诊断等多方面。生物信息学在基因组学研究中贯穿了从数据处理、分析到可视化的各个阶段，对全基因组测序技术的应用起到了至关重要的作用。生物信息学分析软件和平台的开发为同领域研究者更方便、更灵活地开展数据分析和快速选择研究分析工具提供参考。
我们在已有的结核分枝杆菌全基因组数据分析平台的基础上，整合了国家结核病管理信息系统导出的患者流行病学信息，开发了行业首个结核病耐药和传播监测平台。该平台为结核病预防和控制机构及时准确了解当地结核病耐药和传播情况，监测和预警结核病在人群中的传播，为实现结核病的精准防控提供了强有力的技术支撑。
平台功能展示
分析系统主页
1. 患者和菌株数据库
通过统一的患者和菌株信息管理，可查看每例患者的信息（总计、月度分析、年度分析等）和全基因组测序分析结果。
2. 全基因组数据分析
提供耐药预测、数据统计、数据质控、变异信息、耐药突变和分析报告。
总览表
耐药预测：预测17种常见结核药物包含4种一线药物的耐药性和敏感性。
数据统计：碱基比例分布、测序质量分布、测序深度分布、变异检测统计、碱基替换类型分布、 Indel 长度分布、插入片段长度分布。
3. 结核菌耐药监测
分析结核菌耐药类型，对进其行时间、空间、人群统计和可视化。
结核耐药监测分布地图
不同时间统计展示：可按年、月、周统计
人群分布统计展示：可按人群性别、年龄、民族等统计
4. 结核病传播监测分析
快速判定患者是否由近期传播导致发病并识别与其具有传播关系的患者，同时展示这些患者的空间分布特征；统计不同人群的近期传播率，识别近期传播的高危人群。
分析结核菌菌株亲缘关系及可视化
成簇表示样本可以聚类在一起，提示样本间存在传播关系。一个点理论上代表一个样本，但多个样本地理坐标重叠的情况下会存在一个点对于多个样本。
人群分析柱状图
可按性别、年龄、登记分类、职业、户籍地址、耐药类型、标签、分型民族、 涂片结果、合并症统计。统计不同人群的近期传播率，识别近期传播的高危人群。
5. 用户分级管理保证数据安全
保证数据安全：可本地部署，用户分级管理。
6. 关于软件测评
分析系统安装完成后主要需要测试的功能点：
1、准备内部已经分析过的样本
2、样本信息管理（创建单个样本，编辑单个样本，批量导入和删除）
3、上传数据（测试手动上传数据，自动上传需要部署后才能测试）
4、数据分析（启动单个分析和批量启动分析）
5、分析结果查看（选择一个样本对比内部系统的所有结果是否一致，报告是否正常生成和下载）
6、系统管理（增删编辑用户，权限管理）
7、恢复系统（删除添加的样本，数据和用户）
电话：13392273325（微信）
Q Q：2775427010
